El programa de Doctorado en Biociencias mantiene una estrecha colaboración con diferentes instituciones educativas como: la Facultad de Odontología, la Facultad de Medicina Veterinaria y Zootecnia, la Facultad de Ciencias Químicas y la Escuela de Ciencias de la Universidad Autónoma “Benito Juárez” de Oaxaca.

También colabora con el Instituto Tecnológico de Oaxaca, con la Universidad Nacional Autónoma de México, con el Instituto Politécnico Nacional.

Internacionalmente participa con la Universidad de Ciencias y Técnicas de Lille1 en Francia; así como con las siguientes instituciones de salud pública: Hospital General Dr. Aurelio Valdivieso, el Hospital de Especialidades.

Las cuales pueden impactar al programa de posgrado en Biociencias.